В 1604 году по указу царя Бориса Годунова казацким головой Писемский и боярским сыном Тырковым строится крепость, расположившаяся на высокой горе, вблизи впадения в реку Томь Ушайки и по тому названная Томском. В благословение созидаемому граду царь присылает образ Пресвятой Троицы. Повелением государя в городе воздвигается и деревянный храм во имя Живоначальной Троицы. Во круг этого храма начинает созидаться церковная и общественная жизнь на томской земле, возвещаться непреходящая истина святого Евангелия.

Томская епархия в наши дни является одной из 132 епархий Русской Православной Церкви. Ее каноническая территория совпадает с территорией Томской области. В ее состав входят 80 приходов, три монастыря и духовная семинария. Церковная жизнь верующих сосредоточена вокруг храмов и часовен, некоторые из которых сохранились с дореволюционных времен, другие -построены в наши дни. Повсюду ведется реставрация возвращенных епархии храмов, а также строятся новые церкви и часовни. 3аботами главы администрации г. Северска Кузьменко Н.И., при поддержке Сибирского химического комбината и участии многочисленных жителей города возведен величественный шатровый храм в городе атомщиков. Построена красивая церковь во имя всех святых в Земле Российской просиявших в с. Средний Васюган Каргасокского района попечением ОДО "Востокгазпром". В настоящий момент ведется строительство 16-и новых храмов в различных районах области. Богослужения и Таинства, совершаемые в храмах, освящают жизнь человека, преображают его. Здесь человек духовно рождается в Таинстве Крещения, здесь освящает свою жизнь в Таинствах миропомазания, венчания, соборования, исповеди, соединяется со Христом в Таинстве причащения.