Накануне вечером в Казанском храме монастыря было совершено Всенощное бдение, а в сам день праздника - Божественная Литургия. Богослужение возглавил архиепископ Томский и Асиновский Ростислав. Его Высокопреосвященству сослужили наместник монастыря, благочинный церквей Томска и Северска игумен Силуан (Вьюров), настоятель храма Спаса Нерукотворного с. Каргасок, благочинный Северного округа Томской епархии игумен Феодор (Прокопов), настоятель Свято-Покровского храма г. Асино, благочинный Восточного округа Томской епархии протоиерей Андрей Туров, настоятель прихода св. пророка Илии с. Монастырка Шегарского р-на игумен Серафим (Тарабыкин), председатель епархиального Отдела религиозного образования и катехизации иерей Андрей Носков, настоятель храма апостолов Петра и Павла р-на Спичфабрики г. Томска иерей Александр Луговской, настоятель храма святителя Николая при областной психиатрической больнице п. Сосновый бор г. Томска иерей Алексий Коновалов, духовенство обители.

За малым входом Божественной литургии наместник обители игумен Силуан (Вьюров) был возведен в сан архимандрита, а насельники монастыря иеромонах Кирилл (Умрилов) и иеромонах Амвросий (Кузнецов) награждены правом ношения палицы.

По окончании Литургии состоялся торжественный молебен с Крестным ходом вокруг храма. В завершении богослужения архиепископ Ростислав поздравил братию монастыря и всех гостей праздника с юбилеем возрождения обители.

В XX веке Богородице-Алексиевский монастырь разделил судьбу многих обителей России - летом 1923 года он был закрыт. Со временем территория обители была передана в ведение Педагогического училища №2 и застроена новыми домами.

В начале 60-х годов монастырь лишается своего последнего украшения – были разобраны угловые башни и святые врата обители. В 80-х годах минувшего столетия была предпринята попытка восстановить монастырский комплекс в качестве музея, ограничившаяся лишь частичной реставрацией храма обители. В 1991 году территорию обители посетил Святейший Патриарх Алексий II. И уже на следующий год по его благословению епископ Новосибирский и Бердский Тихон совершил торжественное открытие Томского Богородице-Алексиевского монастыря.

Монастырь, переданный Церкви в 1992 году, долго не мог «встать на ноги» – здесь не было постоянного наместника, постоянной братии, некому было служить. Одной из главных причин длительного становления монашеской жизни были сложные бытовые условия, с которыми сталкивались в разоренном монастыре его насельники. У монастыря, расположенного в центре города, не было даже ограды, а братии на первых порах попросту негде было жить, так как единственный на сегодня келейный корпус был возвращен обители только в 1996-м году. Постоянная монастырская братия начала формироваться только летом 1999 года с поставлением нового наместника обители – игумена Силуана (Вьюрова). До того времени жизнь монастырского храма мало чем отличалась от жизни обычного прихода.

За минувшие годы было сделано многое. Прежде всего, сформировалась крепкая монашеская община с установленными правилами распорядка жизни. Братия обители помогают миру не только молитвой, но и трудами на ниве социального служения и духовного просвещения. Так, при монастыре существует Церковно-культурный центр, где проводятся занятия и для детей, и для взрослых. Осуществляется чтение лекций в учебных аудиториях томских вузов и школ. Оказывается помощь бездомным людям.

Томский Богородице-Алексиевский монастырь, бережно сохраняя аскетические и духовно-исторические традиции, продолжает выполнять свою историческую миссию – напоминать людям о Боге и вечности, помогать современному человеку в деле созидания духовной жизни и спасения души.