Богослужебные песнопения исполнял семинарский хор под управлением регента Марины Баевой.

За Литургией молились преподаватели, сотрудники и студенты семинарии.

По окончании богослужения перед ковчегами с мощами святителя Макария (Невского) и святителя-исповедника Агафангела, митрополита Ярославского, был совершен молебен, в ходе которого испрашивалось благословение святых на предстоящие в новом учебном году труды.

Святитель Макарий в годы своего архиерейского служения в Томске (1891-1912) много внимания уделял семинарии. Будущий святой посещал уроки и экзамены, проводил беседы с педагогами и семинаристами, давал советы по правильному ведению воспитательной работы.

Святитель-исповедник Агафангел, митрополит Ярославский, с 1886 по 1888 год в сане игумена бывший инспектором Томской духовной семинарии, стремился к тому, чтобы учащиеся семинарии прежде всего полюбили молитву. Вообще, церковное просвещение и жизнь евхаристическая были важнейшими сторонами деятельности святителя.