Томская Духовная Семинария - одно из самых старых учебных заведений города Томска- была открыта 21 сентября 1858 года стараниями епископа Парфения (Попова). В ней обучалось около 200 человек. Первоначально семинария не имела своего помещения и располагалась в архиерейском доме, но заботами святителя Макария (Невского) в 1899 году она перешла в новое, специально построенное для нее здание. После революции 1917 года семинария была закрыта. Весной 1991 года Сибирь впервые принимала Всероссийского Патриарха. Посетив старейший сибирский город Томск и ознакомившись с церковной и общественной жизнью "Сибирских Афин", Святейший Патриарх Алексий II дал высокую оценку Томску как крупному образовательному центру в Сибири, но при этом высказал свое сожаление о том, что в широком спектре предлагаемого молодежи обучения отсутствует духовное образование. И Патриарх благословил возродить в Томске духовную семинарию.

Духовная Семинария является высшим профессиональным учебным заведением Московского Патриархата, готовящим священнослужителей Русской Православной Церкви. Срок обучения в Семинарии – 5 лет. На время обучения в Томской Духовной Семинарии студенты обеспечиваются бесплатным общежитием и питанием.

Регентское отделение Томской Духовной Семинарии является средним профессиональным учебным заведением Русской Православной Церкви, которое готовит регентов (дирижеров) церковных хоров и псаломщиков.

Курсы проводятся по благословению Высокопреосвященнейшего Ростислава, архиепископа Томского и Асиновского и имеют своей целью ознакомление слушателей с основами православного вероучения. Программа обучения рассчитана на 3 года, занятия проводятся в вечернее время. Занятия проводят преподаватели Томско Духовной семинарии. Обучение бесплатное.