Церковь в честь Трех Святителей некогда существовала на территории древней томской обители. Она была устроена при резиденции первых архипастырей Томской епархии в 30-х годах 19 столетия. Позднее обветшавший храм был разобран, а архиерейский дом с домовой церковью был воздвигнут на новом месте – том самом, на котором ныне выстроен Трехсвятительский монастырский корпус. В архиерейском храме  любил молиться великий старец святой праведный Феодор Томский, проживавший в нашем городе с 1858 по 1864 год, а в конце 19 века эта церковь на протяжении двух десятилетий служила домовым храмом Томской духовной семинарии. В память об этом под престол во время чина освящения была положена частица мощей священноисповедника  Агафангела (Преображенского), который являлся инспектором томской семинарии в те годы, когда она находилась под кровом томской обители, а позднее, уже в сане митрополита Ярославского вновь посетил томскую землю, будучи сослан в в посёлок Колпашёв (ныне г. Колпашево) богоборческой властью.

Новосозданный Трехсвятительский храм построен в традициях византийской крестовокупольной архитектуры, характерной для домонгольской эпохи истории русского церковного зодчества. Выбор архитектурного стиля обусловлен, во-первых, тем, что именно такой тип храма, идеально соответствуя как строю церковного богослужения, так и выработанной веками системе храмовой росписи, является наиболее совершенным выражением канонической православной культуры. Во-вторых, эта культура формировалась благодаря жертвенному  служению сонма святых подвижников Христовой Церкви, в авангарде которых были и те три великих христианских учителя, имени которых посвящен новый монастырский храм.

Кроме храма в новом корпусе разместились братские кельи, паломническая гостиница, а также духовно-культурный центр, включающий на сегодня детскую воскресную школу и лекторий для взрослых и открывающий широкие возможности для духовно-просветительской деятельности.

Фоторепортаж об освящении храма: прот.Александр Классен